Optimisation de l'homogénéisation des échantillons

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Jun 28, 2023

Optimisation de l'homogénéisation des échantillons

Les chercheurs dans de nombreux domaines doivent extraire des molécules d’intérêt à partir d’échantillons pour une analyse plus approfondie. Une étape critique et précoce dans la procédure d’isolement est l’homogénéisation des tissus ou la rupture cellulaire,

Les chercheurs dans de nombreux domaines doivent extraire des molécules d’intérêt à partir d’échantillons pour une analyse plus approfondie. L’homogénéisation des tissus ou la rupture cellulaire, processus au cours duquel les cellules sont lysées pour libérer des analytes intracellulaires, tels que des acides nucléiques, des protéines ou des métabolites, constitue une étape cruciale et précoce de la procédure d’isolement. Ces molécules peuvent être analysées à l’aide de diverses techniques, notamment la PCR, le NGS et le Western blot. Ces méthodes d’analyse s’appuyant toutes sur une préparation d’échantillons efficace et reproductible, l’optimisation de cette étape est une priorité.

La technique d'homogénéisation la plus traditionnelle implique la pulvérisation mécanique d'échantillons de tissus à l'aide d'un mortier et d'un pilon. Cependant, cette procédure prend du temps, est laborieuse et peut ne pas être optimale en fonction des propriétés physico-chimiques de l'échantillon.1 Les méthodes non mécaniques, notamment la lyse chimique et la sonication, peuvent également homogénéiser les échantillons. Cependant, la chaleur générée par la sonication et les détergents utilisés dans la lyse chimique peuvent être agressives pour les molécules fragiles, telles que l'ARN.1,2

Des méthodes mécaniques développées plus récemment réduisent le travail et le temps requis pour la lyse, tout en augmentant l'efficacité de l'homogénéisation. Par exemple, la technologie de battage de billes 3D utilise un mouvement de billes rapidement accéléré pour broyer des échantillons de tissus.1 Les billes à l’intérieur des tubes de lyse sont agitées selon un mouvement oscillant multidirectionnel. De plus, un large assortiment de kits de lyse est disponible et offre la possibilité d'homogénéiser tout type d'échantillon biologique. Ces kits comprennent des tubes d'un volume allant de 0,3 à 15 ml, ainsi que des billes composées de céramique, de verre ou d'acier inoxydable, dont le diamètre varie.

Outre les défis associés à la méthode de lyse choisie, les propriétés d'un échantillon peuvent également gêner l'extraction de l'analyte. Certains échantillons ne fournissent qu’une petite quantité d’analytes, comme l’ADN des spermatozoïdes. Par conséquent, les chercheurs doivent traiter des volumes d’échantillons plus importants, qui prennent plus de temps à s’homogénéiser et peuvent dépasser les limites de volume maximales de l’instrument. De plus, certains échantillons, tels que les graines, la peau, les os ou les tissus dérivés d'une tumeur, sont difficiles à homogénéiser en raison de leur dureté, de leur élasticité, de leur minéralisation ou de leur nature fibreuse.1,3–5 Ce qui aggrave encore le problème, les échantillons difficiles à homogénéiser. la lyse génère plus de chaleur, conduisant à la dégradation ou à la dénaturation de certains analytes thermosensibles.

Le Precellys® Evolution Touch est un homogénéisateur polyvalent de Bertin Technologies. Il utilise la technologie de battage des billes, qui constitue la référence en matière d'homogénéisation des tissus, pour broyer même les échantillons les plus difficiles, tels que les dents et les cheveux, en quelques minutes. Il est capable de traiter des échantillons de différentes tailles, poids et volumes. De plus, il peut homogénéiser jusqu’à vingt-quatre échantillons simultanément. Comme la symétrie de l'instrument permet à tous les tubes de suivre le même mouvement, elle garantit une efficacité d'homogénéisation égale pour chaque échantillon. Le Precellys® Evolution Touch est équipé d'un écran tactile réactif même lorsque l'utilisateur porte des gants. De plus, les chercheurs peuvent choisir entre trente kits de lyse différents conçus pour homogénéiser des échantillons de différentes propriétés et volumes. Grâce à des vitesses allant jusqu'à 10 000 tr/min, une chaleur minimale est générée à travers les échantillons, garantissant ainsi la sécurité des analytes thermosensibles. De plus, l'instrument est compatible avec l'unité de refroidissement Cryolys Evolution, ce qui lui permet de maintenir la température de l'échantillon entre 0 et 10 °C avant et pendant l'homogénéisation.

Basé sur la variété de tailles de tubes acceptées, les nombreuses options de kits de lyse et la capacité de traiter plusieurs échantillons simultanément, le Precellys® Evolution Touch est un homogénéisateur polyvalent et efficace adapté à de nombreux domaines de recherche.

Les références

Défis liés aux méthodes d'homogénéisation existantesPropriétés des échantillons problématiquesBertin TechnologiesLa solution pour homogénéiser les échantillons difficiles